Biodiversidad genética de endobacterias asociadas a la lombriz de tierra eisenia foetida.

Abstract

El suelo es un sistema complejo y heterogéneo que alberga una importante diversidad de organismos y dentro de este sistema se encuentra la lombriz de tierra Eisenia foetida la cual se ha generalizado su uso en procesos de vermiremediación. El objetivo de este trabajo fue estudiar y caracterizar la diversidad genética de bacterias endosimbióticas asociadas a Eisenia foetida usando técnicas microscópicas, tinciones diferenciales, herramientas moleculares y genómicas. Las endobacterias fueron aisladas del intestino de la lombriz de tierra y cultivas en medios específicos Agar Nutritivo (AN), Agar Infusión Cerebro Corazón (ICC), Agar Rojo Congo (RC) y Agar Soya Tripticaseína (TSA). La característica de la célula bacteriana, así como la morfología de las colonias en los medios de cultivo selectivo fueron estudiadas. El estatus taxonómico de las cepas bacterianas fue estudiado usando el marcador molecular 16S rRNA y mediante huellas genómicas ERIC_PCR y RFLP. La identificación de las cepas fue realizada mediante análisis filogenético basado en el gen rrs. Se obtuvieron 74 cepas endobacterianas del intestino de E. foetida, de las cuales 24 cepas crecieron en medio AN, 21 en Agar Rojo Congo, 15 en ICC y 14 en Agar TSA. ERIC_PCR permitió obtener 16 patrones de huellas genómicos distintos y con RFLP se obtuvieron 7 patrones de restricción. De acuerdo al análisis filogenético basado en el gen 16S rRNA se identificaron 4 géneros distintos, Bacillus, Caryophanon/Solibacillus, Paenibacillus, Pseudomonas.