EXTRACCION DEL DNA METAGENÓMICO Y AMPLIFICACIÓN DEL GEN 16S rRNA PARA EL ANÁLISIS DEL RESISTOMA DEL SUELOS

Abstract

El presente trabajo comprende la primera etapa de un proyecto mayor, encaminado al estudio de bacterias resistentes a antibióticos provenientes del suelo, que consistió en el establecimiento de cultivos microbianos, en un Medio de cultivo con extracto de levadura (PY). Se ensayó un total 25 antibióticos comerciales en tres extractos diferentes de suelo; 1) Un suelo urbano expuesto permanentemente a aguas contaminadas, 2) Un suelo de uso agrícola y 3) Un suelo perteneciente a un área natural. Después de una incubación de 10 días con el antibiótico, se extrajo el DNA de las bacterias resistentes. El material genético se purificó, se cuantificó y se amplificó la región V1-V3 del gen 16S rRNA obteniendo un tamaño molecular de 500pb. Por último los amplicones se purificaron y se cuantificaron. Finalmente los productos de amplificación obtenidos en el presente trabajo de licenciatura, servirán para un estudio más complejo, que pretende pirosecuenciar las librerías obtenidas, e identificar los grupos bacterianos, así como la riqueza y abundancia de estos grupos con la ayuda de programas bioinformáticos.